یکی از چالش های پرینت سه بعدی نایلون(Nylon) این است که نایلون بسیار جذب کننده رطوبت است. حتی قرار گرفتن کوتاه مدت در معرض رطوبت بالا می تواند منجر به فیلامنت “خیس” شود که هنگام چاپ می تواند منجر به ناهماهنگی در دقت ابعاد و استحکام قطعه شود. با توجه به این خاصیت، نگهداری رشته نایلونی در جای خشک بسیار مهم است. پرینترهای حرفه ای سه بعدی FDM محصور شده اند تا بتوان با خیال راحت از رطوبت جلوگیری کرد، اما برای کاربران جدیدی که با پرینترهای رومیزی DIY یا ارزان تر کار می کنند، مواد هنگام چاپ در معرض هوا قرار می گیرند. این باعث می شود که مستعد رطوبت باشد. رطوبت جذب شده توسط نایلون با عبور از بخاری گرم می شود و رطوبت حباب هایی تشکیل می دهد که در طول فرآیند گرمایش می ترکد. این ترکیدن شکاف های قابل مشاهده ای در قطعات پرینت سه بعدی ایجاد می کند که منجر به خروجی ضعیف می شود.