اولین مرحله از هر فرآیند پرینت سه بعدی ، مدل سازی سه بعدی است. برای به حداکثر رساندن دقت ، همه اشیا باید در یک نرم افزار مدل سازی سه بعدی طراحی شوند.
برخی از طرح ها برای روش های تولید سنتی بسیار پیچیده و دقیق هستند. این همان جایی است که این نرم افزار CAD وارد بازار می شود. مدل سازی به پرینتر های سه بعدی اجازه می دهد محصول خود را تا کوچکترین جزئیات سفارشی کنند.
توانایی نرم افزار مدل سازی سه بعدی برای اجازه دادن به طراحی های دقیق به همین دلیل است که چاپ سه بعدی به عنوان یک تغییر دهنده واقعی بازی در بسیاری از صنایع مورد استقبال قرار می گیرد.
این نرم افزار مدلسازی خصوصاً در صنایعی مانند دندانپزشکی که آزمایشگاه ها از نرم افزار سه بعدی برای طراحی ردیف کننده های دندان استفاده می کنند که دقیقاً متناسب با فرد باشد از اهمیت ویژه ای برخوردار است.
این برای صنعت فضایی نیز بسیار حیاتی است ، جایی که آنها از نرم افزار برای طراحی برخی از پیچیده ترین قسمتهای موشک استفاده می کنند .